Equipo profesional con doctores e investigadores contrastados al frente.
No más opacidad. La información y los procesos, claros y entendibles.
Nos adaptamos exactamente a lo que necesite el proyecto. Hablemos.
Este tipo de estudios cuestan menos y valen mucho más de lo que se suele pensar.
En bases de datos de dominio público como GreenGenes o RDP la identificación a nivel de especie no supera el 6%.
En Helix BioS apostamos por el por el I+D+i. Por eso trabajamos con bases de datos y pipelines de desarrollo propio (propiedad intelectual registrada) que cumplen con las siguientes características de calidad:
Pregúntenos lo que necesite saber acerca de este servicio. ¡Hablemos!
En Helix Bios analizamos la información obtenida mediante la secuenciación de RNA (RNA-seq) para esclarecer los estados o procesos presentes en una célula, tejido, organismo o comunidad microbiana.
Estudiamos y analizamos desde la expresión de genes y transcritos basados en RNA mensajero (mRNA), y otros tipos de RNA presentes como el Ribosomal, RNA circulares (circRNA) o microRNA (miRNA), entre otros.
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1. Grupos de investigación clínica
2. Grupos de investigación no clínica (veterinaria, industrial, agrícola) para identificar las especies presentes en muestras de suelo, biorreactores, de tejidos/residuos animales, etc
3. Particulares que quieran determinar la presencia de alguna bacteria u hongo en suelos de cultivo
4. Particulares o grupos de investigación.
Con ellos, ya trabajamos para crear un mundo mejor
Usando regiones concretas del DNA o todo el DNA, se procede a estudiar y discernir los organismos presentes en la muestra y otras características de este (metabarcoding).
Se procede a la reconstrucción de los genes que se están expresando en la muestra. Esto permite estudiar qué rutas están activas, qué proteínas se están sintetizando, etc (metatranscriptómica).
HUMAN GUT 16: Base de datos del microbioma intestinal humano para estudios de metagenómica basados en el rRNA 16S.
Titular Helix Bioinformatics Solutions S.L. ®Todos los derechos reservados.
Base de datos ambiental para estudios de metagenómica de bacterias (16S).
Titular Helix Bioinformatics Solutions S.L. ®Todos los derechos reservados.
Para conseguir datos fiables, en Helix Bios trabajamos con la mayor precisión, concentración y planificación posible.
Objetivo, número y tipo de muestras, definición de variables.
Plan de muestreo, toma de muestras, almacenamiento.
Kits especializados en el tipo de muestra y el tipo de material a extraer, DNA o RNA.
Tecnología illumina Paired-End adaptada a la molécula y necesidades:
1. Secuenciación de amplicones para metabarcoding de DNA.
- Secuenciación de todo el DNA.
- Secuenciación de todo el RNA.
1. Construcción de bases de datos para las anotaciones del proyecto.
2. Metabarcoding o identificación de taxones.
3. Reconstrucción de metagenoma y anotación.
4. Reconstrucción de metatranscriptoma, anotación y expresión.
1. RNA-seq: Análisis de expresión diferencial de genes y transcritos o cualquier otra molécula de RNA relevante.
2. Metagenómica: Análisis de la microbiota:
- Análisis de la biodiversidad: alfa y beta índices.
- Análisis diferencial de la abundancia
¿Necesita más información? ¿Le gustaría tener un presupuesto?
Hablemos de forma cercana y transparente para abordar sus proyectos.