Datos de alta calidad para proyectos exigentes
Análisis de RNA-seq
Extracción, secuenciación NGS y análisis completo para evaluar la expresión génica
Garantía
Equipo internacional con doctores e investigadores contrastados al frente.
Transparencia
No más opacidad. La información y los procesos, claros y entendibles.
Flexibilidad
Nos adaptamos exactamente a lo que necesite el proyecto en tiempos y exigencia.
Asequibilidad
Este tipo de estudios cuestan menos de lo que mucha gente piensa. ¿Hablamos?
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En Helix Bios analizamos la información obtenida mediante la secuenciación de RNA (RNA-seq) para esclarecer los estados o procesos presentes en una célula, tejido, organismo o microorganismo.
Estudiamos y analizamos la expresión de genes y transcritos basados en RNA mensajero y otros tipos (circRNA, miRNA…)
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En Helix Bios analizamos la información obtenida mediante la secuenciación de RNA (RNA-seq) para esclarecer los estados o procesos presentes en una célula, tejido, organismo o comunidad microbiana.
Estudiamos y analizamos desde la expresión de genes y transcritos basados en RNA mensajero (mRNA), y otros tipos de RNA presentes como el Ribosomal, RNA circulares (circRNA) o microRNA (miRNA), entre otros.
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Confianza y experiencia científica
Con ellos, ya trabajamos para crear un mundo mejor
¿A quién le interesa?
1. Grupos de investigación clínica que quieran estudiar los patrones de expresión entre pacientes y gente sana.
2. Grupos de investigación farmacológica que ver las diferencias en la expresión de determinados genes en respuesta a un tratamiento o fármaco.
3. Estudios clínicos en los que se sospeche el cambio en la expresión de determinados genes como causa de los síntomas o respuesta de un paciente.
4. Diagnóstico clínico en el que una expresión diferente puede ser la causa del problema.
Estudios RNAseq disponibles
Análisis de expresión
Centrados en el RNA mensajero, evaluamos los niveles de expresión de los genes o transcritos que están presentes en las muestras. Enfrentando las lecturas contra una referencia podemos anotar los biotipos de los transcritos presentes y obtener la información de expresión de estos. También estudiamos las isoformas no convencionales, provenientes de splicing alternativo.
Análisis de Fusiones
Estudiamos y anotamos las fusiones que se encuentran en dos segmentos del genoma (que normalmente están separados) localizándolos y analizando a qué genes afecta, etc.
Análisis de micro-RNA
La función de los miRNA es muy importante para la regulación de la expresión ya que algunos pueden activar la transcripción de genes y otros, silenciarlos. En Helix Bios determinamos qué miRNA están presentes en las muestras, la presencia de algunas variantes nuevas de éstos y sus valores de expresión.
Análisis de circularización
Algunos mRNA pueden circularizarse cambiando sus niveles de expresión, lo que puede explicar ciertas pautas o atributos en los proyectos. Analizamos los circRNA, obteniendo la expresión de éstos y sus contrapartidas lineales para presentar toda la información posible.
Análisis de variantes
Buscamos mutaciones en el genoma y el transcriptoma. Realizamos un análisis profundo filtrando las variantes por su importancia y usando bases de datos de prestigio para anotar su efecto, función, gen, etc. Además, determinamos si son variantes que vienen del genoma o se han producido de manera post-transcripcional.
Transcriptoma de novo / Metatranscriptoma
El ensamblaje de novo es uno de los procedimientos empleados para reconstruir genomas, sin la ayuda de un genoma de referencia. Reconstruimos el transcriptoma con los transcritos presentes en la muestra y midiendo sus niveles de expresión. Los anotamos y comparamos con diferentes bases de datos para poder encontrar aquellos genes/transcritos que sean de interés para el proyecto.
Organización, la clave del éxito
Para conseguir datos fiables, en Helix Bios trabajamos con la mayor precisión, concentración y planificación posible.
1. DISEÑO DEL PROYECTO
- Objetivo
- Número y tipo de muestras
- Tipo de RNA a estudiar
- Definición de variables
2. EXTRACCIÓN DE MATERIAL GENÉTICO
Kits de extracción especializados según tipo de muestra
3. SECUENCIACIÓN NGS
Tecnología illumina Paired-End adaptada a molécula y necesidades
- Solo el RNA mensajero (mRNA).
- Todo el RNA presente (totalRNA).
- Un tipo concreto de RNA (microRNA, miRNA, etc.)
4. ESTUDIO BIOINFORMÁTICO
Para Genoma de referencia:
1. Alineamiento frente al genoma de referencia.
2. Cálculo y obtención de las métricas de expresión de los genes o de los tipos de RNA que se necesiten.
Para estudios de ensamblado de novo del transcriptoma:
1. Reconstrucción del transcriptoma, anotación y análisis de los valores expresión.
5. ANÁLISIS DATOS ÓMICOS
1. RNA-seq: Análisis de expresión diferencial de genes y transcritos o cualquier otra molécula de RNA relevante.
2. Análisis de las formas y expresión de los RNA circulares (circRNA).
3. Análisis de las formas y expresión de los miRNA (formas inmaduras y maduras).
Su investigación, en buenas manos
Equipo internacional
Equipo con diferentes áreas de conocimiento, en distintos países y con un objetivo común: proveer al sector biotecnológico de los servicios bioinformáticos necesarios para su desarrollo y crecimiento.
Confidencialidad
En Helix BioS nos tomamos muy en serio el correcto tratamiento de los datos sensibles confiados por nuestros clientes. Contamos con un equipo de abogados altamente cualificados en el Reglamento de Protección de datos (RGPD) que supervisarán todo el proceso.
Cercanía
Para garantizar unos resultados de calidad y a la carta nos involucramos en cada una de las etapas que constituyen los proyectos con transparencia y cercanía con el cliente. En todo momento. En todos los pasos.
4ª Revolución industrial
Creemos que las respuestas esenciales para controlar los problemas de salud, medioambientales, alimentarios y, en general, de sostenibilidad, las encontraremos en el sector biotecnológico.
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