Nos tomamos en serio la ciencia

Metagenómica

Análisis de las características de un ecosistema a través de la secuenciación y estudio de su material genético (DNA o RNA).

Garantía

Equipo profesional con doctores e investigadores contrastados al frente.

Transparencia

No más opacidad. La información y los procesos, claros y entendibles.

Flexibilidad

Nos adaptamos exactamente a lo que necesite el proyecto. Hablemos.

Asequibilidad

Este tipo de estudios cuestan menos y valen mucho más de lo que se suele pensar.

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Resoluciones taxonómicas reales.
Bases de datos propias.
Precios competitivos.

Consúltenos y estudiaremos el caso de su proyecto para asesorarle.

En bases de datos de dominio público como GreenGenes o RDP la identificación a nivel de especie no supera el 6%. 

En Helix BioS apostamos por el por el I+D+i. Por eso trabajamos con bases de datos y pipelines de desarrollo propio (propiedad intelectual registrada) que cumplen con las siguientes características de calidad: 

  1. Anotaciones lo más completas posibles.
  2. Secuencias derreplicadas.
  3. Anotaciones corregidas y revisadas por expertos
  4. Secuencias actualizadas.
  5. Concreta para el ámbito de estudio.
 

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Datos precisos.
Análisis sólidos.
Precios competitivos.

En Helix Bios analizamos la información obtenida mediante la secuenciación de RNA (RNA-seq) para esclarecer los estados o procesos presentes en una célula, tejido, organismo o comunidad microbiana. 

Estudiamos y analizamos desde la expresión de genes y transcritos basados en RNA mensajero (mRNA), y otros tipos de RNA presentes como el Ribosomal, RNA circulares (circRNA) o microRNA (miRNA), entre otros.

 
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analisis de RNA

¿A quién le interesa?

1. Grupos de investigación clínica

  •  Identificar cepas o especies en muestras biológicas de pacientes u hospitales.
  •  Identificar genes de resistencia a antibióticos o factores de virulencia en muestras de pacientes u hospitales.

2. Grupos de investigación no clínica (veterinaria, industrial, agrícola) para identificar las especies presentes en muestras de suelo, biorreactores, de tejidos/residuos animales, etc

3. Particulares que quieran determinar la presencia de alguna bacteria u hongo en suelos de cultivo

4. Particulares o grupos de investigación.

  • Analizar alimentos para encontrar posibles bacterias patógenas.
  • Determinar la resistencia a diferentes substancias (metales pesados) de las bacterias presentes en sus áreas de trabajo (suelos, reactores, etc.).

Confianza y experiencia científica

Con ellos, ya trabajamos para crear un mundo mejor

Estudios metagenómicos disponibles

DNA

Usando regiones concretas del DNA o todo el DNA, se procede a estudiar y discernir los organismos presentes en la muestra y otras características de este (metabarcoding).

RNA

Se procede a la reconstrucción de los genes que se están expresando en la muestra. Esto permite estudiar qué rutas están activas, qué proteínas se están sintetizando, etc (metatranscriptómica).

Bases de datos registradas

HUMAN GUT 16: Base de datos del microbioma intestinal humano para estudios de metagenómica basados en el rRNA 16S. 

Titular Helix Bioinformatics Solutions S.L. ®Todos los derechos reservados.

Base de datos ambiental para estudios de metagenómica de bacterias (16S).

Titular Helix Bioinformatics Solutions S.L. ®Todos los derechos reservados.

Organización, la clave del éxito

Para conseguir datos fiables, en Helix Bios trabajamos con la mayor precisión, concentración y planificación posible. 

1. DISEÑO DEL PROYECTO ⇒

Objetivo, número y tipo de muestras, definición de variables.

2. TOMA DE MUESTRAS ⇒

Plan de muestreo, toma de muestras, almacenamiento.

3. EXTRACCIÓN DE DNA/RNA ⇒

Kits especializados en el tipo de muestra y el tipo de material a extraer, DNA o RNA.

4. SECUENCIACIÓN NGS ⇒

Tecnología illumina Paired-End adaptada a la molécula y necesidades:
1. Secuenciación de amplicones para metabarcoding de DNA.
- Secuenciación de todo el DNA.
- Secuenciación de todo el RNA.

5. ESTUDIO BIOINFORMÁTICO PERSONALIZADO

1. Construcción de bases de datos para las anotaciones del proyecto.
2. Metabarcoding o identificación de taxones.
3. Reconstrucción de metagenoma y anotación.
4. Reconstrucción de metatranscriptoma, anotación y expresión.

6. ANÁLISIS DATOS ÓMICOS

1. RNA-seq: Análisis de expresión diferencial de genes y transcritos o cualquier otra molécula de RNA relevante.
2. Metagenómica: Análisis de la microbiota:
- Análisis de la biodiversidad: alfa y beta índices.
- Análisis diferencial de la abundancia

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Estamos a un click

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Hablemos de forma cercana y transparente para abordar sus proyectos.

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